农业农村部南海渔业资源环境重点野外科学观测试验站于2005年由农业部正式命名。2010年，农业农村部启动“海洋渔业与可持续发展”学科群建设，本站按要求更名为“农业农村部南海渔业资源环境科学观测实验站”，成为农业农村部第一批建设的农业科学观测实验站。
        从1979年农业农村部批复开展南海渔业资源环境监测工作至今，经过30余年不懈努力，本站已建设成为我国大陆南部唯一的、具有明显热带亚热带区域代表性的海洋渔业资源与生态环境科学观测实验站。
        本站实行开放、流动、竞争、联合的运行机制，对国内外开放，是南海渔业资源环境领域获取原始资料和基础数据、开展渔业综合科学研究、服务渔业生产的重要科技创新平台。
        主要研究方向：南海及其河口水域渔业资源动态监测与研究、渔业生态环境监测与质量评价、水产种质资源监测、保存与开发利用、渔业生物多样性及珍稀濒危水生野生动物监测与调查。